Marek Kowalczyk swoją karierę zawodową związał ze środowiskiem drogowym. W 1981 r. obronił dyplom magisterski na Akademii Techniczno-Rolniczej w Bydgoszczy (obecnie Politechnika Bydgoska) w Instytucie Budownictwa Lądowego, w zakresie budownictwa (specjalność: drogi, ulice i lotniska). Pracował m.in. w Komunalnym Przedsiębiorstwie Robót Drogowych, Przedsiębiorstwie Robót Mostowych "MOST-ŁÓDŹ", Urzędzie Wojewódzkim w Bydgoszczy, Urzędzie Miasta w Bydgoszczy. Od 1994 r. tworzył podstawy Zarządu Dróg Miejskich i Komunikacji Publicznej w Bydgoszczy, przez wiele lat kierując nim jako dyrektor. W latach 2007-2012 był Dyrektorem Oddziału Generalnej Dyrekcji Dróg Krajowych i Autostrad w Bydgoszczy.
Marek Kowalczyk zmarł w piątek, 13 stycznia 2023 r. w wieku 65 lat. Jego ostatnie pożegnanie odbyło się 20 stycznia na Cmentarzu Komunalnym przy ul. Wiślanej w Bydgoszczy.
Zobacz wideo: Rok 2023 w Bydgoszczy ogłoszony został rokiem Andrzeja Szwalbego
