Odpady wytwarzane w miejscach kwarantanny lub izolacji stanowią odpady komunalne, które muszą być gromadzone i odbierane w sposób specjalny tzn. bez styczności z pozostałymi odpadami komunalnymi wytwarzanymi przez mieszkańców.

Odpady z nieruchomości objętych kwarantanną mogą odbierać wyłącznie pracownicy Spółki ProNatura. Są oni wyposażeni w kombinezony, maseczki, rękawiczki oraz środki dezynfekujące. Pracownicy odbierający takie odpady są oddzieleni od reszty załogi i poruszają się wydzielonym pojazdem.

Odpady są przewożone do Zakładu Termicznego Przekształcania Odpadów Komunalnych, po czym wsypywane są do bunkru przez wydzieloną do tego celu bramę, a następnie spalane.